Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm20830J3KML6 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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