Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Vmn1r34G3XA52 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Vmn1r34G3XA52 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Vmn1r34G3XA52 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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