Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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