Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Clrn2B2RVW2 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms