Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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Gm6880A3KG45 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Gm6880A3KG45 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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Gm6880A3KG45 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm6880A3KG45 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Gm6880A3KG45 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6880A3KG45 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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