Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
NfkbiaQ9Z1E3 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms