Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Actr2-201ENSMUST00000000137 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 A330032B11Rik-201ENSMUST00000180609 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Slc2a1-201ENSMUST00000030398 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Pla2g4e-201ENSMUST00000090071 4477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Anpep-201ENSMUST00000049004 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Nuggc-201ENSMUST00000079469 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Dgkeos-204ENSMUST00000178493 1902 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 A530021J07Rik-202ENSMUST00000207727 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 D030018L15Rik-202ENSMUST00000139808 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Iqcg-202ENSMUST00000115100 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm26805-201ENSMUST00000181885 3089 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 9130221F21Rik-201ENSMUST00000206867 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Platr9-202ENSMUST00000149572 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 AC132467.2-201ENSMUST00000226306 2253 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trem1Q9JKE2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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