Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
OtofQ9ESF1 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms