Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Tlnrd1Q9ERE8 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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