Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T0

Fam3a, Protein FAM3A, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3aQ9D8T0 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam3aQ9D8T0 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms