Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
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Nop56Q9D6Z1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
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Nop56Q9D6Z1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Nop56Q9D6Z1 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Nop56Q9D6Z1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Nop56Q9D6Z1 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
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Nop56Q9D6Z1 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Nop56Q9D6Z1 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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