Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed11Q9D2R4 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms