Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed9Q99KF1 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed9Q99KF1 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed9Q99KF1 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed9Q99KF1 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed9Q99KF1 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed9Q99KF1 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed9Q99KF1 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed9Q99KF1 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed9Q99KF1 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed9Q99KF1 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed9Q99KF1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed9Q99KF1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed9Q99KF1 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed9Q99KF1 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed9Q99KF1 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed9Q99KF1 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed9Q99KF1 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed9Q99KF1 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed9Q99KF1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms