Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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