Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Vmn1r200Q8R281 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Vmn1r200Q8R281 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Vmn1r200Q8R281 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vmn1r200Q8R281 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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