Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ncapd2Q8K2Z4 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms