Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc17Q8CE13 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms