Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ubash3bQ8BGG7 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms