Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 AC110091.3-201ENSMUST00000213406 1304 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Fthl17b-201ENSMUST00000105006 842 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm20629-201ENSMUST00000176157 513 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm23908-201ENSMUST00000104599 132 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm11789-205ENSMUST00000148579 649 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm4866-201ENSMUST00000197408 589 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Rce1-203ENSMUST00000224707 1255 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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AtmQ62388 Gm14630-201ENSMUST00000118057 246 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm5845-201ENSMUST00000195812 796 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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AtmQ62388 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 D730045A05Rik-201ENSMUST00000159260 1269 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm28499-201ENSMUST00000191576 666 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Rp1-202ENSMUST00000194992 858 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
AtmQ62388 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms