Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ptcd3Q14C51 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ptcd3Q14C51 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ptcd3Q14C51 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ptcd3Q14C51 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ptcd3Q14C51 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ptcd3Q14C51 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms