Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ttc21bQ0HA38 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ttc21bQ0HA38 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ttc21bQ0HA38 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ttc21bQ0HA38 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ttc21bQ0HA38 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc21bQ0HA38 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms