Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms