Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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