Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H3f3aP84244 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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