Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tuba4aP68368 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tuba4aP68368 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Tuba4aP68368 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tuba4aP68368 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tuba4aP68368 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms