Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rps3P62908 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rps3P62908 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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