Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Gsc2P56916 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Gsc2P56916 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Gsc2P56916 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Gsc2P56916 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Gsc2P56916 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Gsc2P56916 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Gsc2P56916 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gsc2P56916 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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