Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms