Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Syncrip-207ENSMUST00000174269 3286 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm38910-201ENSMUST00000204630 2448 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm45889-202ENSMUST00000211255 2358 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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Sh3bp1P55194 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Sh3bp1P55194 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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Sh3bp1P55194 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm9271-201ENSMUST00000185988 2580 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms