Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fgd1P52734 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms