Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
FmodP50608 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
FmodP50608 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
FmodP50608 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
FmodP50608 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
FmodP50608 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
FmodP50608 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
FmodP50608 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
FmodP50608 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
FmodP50608 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
FmodP50608 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
FmodP50608 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
FmodP50608 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
FmodP50608 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
FmodP50608 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
FmodP50608 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
FmodP50608 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms