Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LtbrP50284 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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