Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epb41P48193 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epb41P48193 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epb41P48193 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epb41P48193 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms