Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrbP28704 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrbP28704 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrbP28704 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrbP28704 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms