Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Atxn10P28658 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Atxn10P28658 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Atxn10P28658 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Atxn10P28658 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Atxn10P28658 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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