Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BrafP28028 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BrafP28028 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BrafP28028 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BrafP28028 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BrafP28028 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BrafP28028 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BrafP28028 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BrafP28028 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BrafP28028 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BrafP28028 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BrafP28028 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BrafP28028 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BrafP28028 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BrafP28028 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms