Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PdgfraP26618 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PdgfraP26618 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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