Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sp100O35892 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Sp100O35892 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Sp100O35892 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Sp100O35892 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Sp100O35892 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Sp100O35892 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Sp100O35892 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Sp100O35892 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Sp100O35892 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Sp100O35892 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Sp100O35892 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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Sp100O35892 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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Sp100O35892 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sp100O35892 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sp100O35892 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sp100O35892 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Sp100O35892 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
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