Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kpna3O35344 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kpna3O35344 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms