Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr1aO35134 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms