Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Casq1O09165 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Casq1O09165 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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