Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm21818J3KMS6 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms