Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-M1F7CXU4 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms