Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Arl14ep-202ENSMUST00000093883 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm37398-201ENSMUST00000191914 1466 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm11480-201ENSMUST00000120214 659 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 A930014E10Rik-201ENSMUST00000205115 546 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Olfr1065-203ENSMUST00000216165 992 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
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Gm3250E9Q1M3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
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Gm3250E9Q1M3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
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