Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Scn8a-213ENSMUST00000201549 7120 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Ikbkg-201ENSMUST00000004330 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Nav2-202ENSMUST00000064395 11317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Clcn3-202ENSMUST00000056508 5684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm21969-201ENSMUST00000178644 4402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Col4a5-201ENSMUST00000112930 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Hivep3-209ENSMUST00000166542 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms