Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3238W4VSP7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3238W4VSP7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3238W4VSP7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3238W4VSP7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3238W4VSP7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3238W4VSP7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3238W4VSP7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3238W4VSP7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3238W4VSP7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3238W4VSP7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3238W4VSP7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3238W4VSP7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3238W4VSP7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3238W4VSP7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3238W4VSP7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3238W4VSP7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3238W4VSP7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3238W4VSP7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3238W4VSP7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3238W4VSP7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3238W4VSP7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3238W4VSP7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3238W4VSP7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3238W4VSP7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3238W4VSP7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3238W4VSP7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3238W4VSP7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm3238W4VSP7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3238W4VSP7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3238W4VSP7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3238W4VSP7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3238W4VSP7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms