Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PdfS4R2K0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PdfS4R2K0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PdfS4R2K0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms