Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt27Q9Z320 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms