Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vamp5Q9Z2P8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vamp5Q9Z2P8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vamp5Q9Z2P8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms