Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd2Q9Z2E1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mbd2Q9Z2E1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms